Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BMI1P35226 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BMI1P35226 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BMI1P35226 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BMI1P35226 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BMI1P35226 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BMI1P35226 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BMI1P35226 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BMI1P35226 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BMI1P35226 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BMI1P35226 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BMI1P35226 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BMI1P35226 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BMI1P35226 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BMI1P35226 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BMI1P35226 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BMI1P35226 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BMI1P35226 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BMI1P35226 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BMI1P35226 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BMI1P35226 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BMI1P35226 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BMI1P35226 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BMI1P35226 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BMI1P35226 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BMI1P35226 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BMI1P35226 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BMI1P35226 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BMI1P35226 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BMI1P35226 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BMI1P35226 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BMI1P35226 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BMI1P35226 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BMI1P35226 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BMI1P35226 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BMI1P35226 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BMI1P35226 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BMI1P35226 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BMI1P35226 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BMI1P35226 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BMI1P35226 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BMI1P35226 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BMI1P35226 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BMI1P35226 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BMI1P35226 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BMI1P35226 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BMI1P35226 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BMI1P35226 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BMI1P35226 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BMI1P35226 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BMI1P35226 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BMI1P35226 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BMI1P35226 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BMI1P35226 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BMI1P35226 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BMI1P35226 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BMI1P35226 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BMI1P35226 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BMI1P35226 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BMI1P35226 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms