Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFN2P35080 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFN2P35080 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFN2P35080 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFN2P35080 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFN2P35080 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFN2P35080 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFN2P35080 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFN2P35080 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PFN2P35080 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PFN2P35080 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PFN2P35080 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PFN2P35080 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PFN2P35080 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PFN2P35080 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFN2P35080 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFN2P35080 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFN2P35080 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFN2P35080 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFN2P35080 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PFN2P35080 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PFN2P35080 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PFN2P35080 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFN2P35080 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFN2P35080 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFN2P35080 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFN2P35080 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFN2P35080 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFN2P35080 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFN2P35080 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms