Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA4P34932 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA4P34932 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HSPA4P34932 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms