Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP1P32455 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP1P32455 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP1P32455 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP1P32455 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBP1P32455 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBP1P32455 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP1P32455 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP1P32455 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP1P32455 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP1P32455 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP1P32455 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP1P32455 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP1P32455 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP1P32455 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP1P32455 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP1P32455 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP1P32455 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP1P32455 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP1P32455 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP1P32455 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP1P32455 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP1P32455 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GBP1P32455 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GBP1P32455 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP1P32455 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP1P32455 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP1P32455 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP1P32455 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP1P32455 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP1P32455 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP1P32455 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP1P32455 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP1P32455 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP1P32455 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP1P32455 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP1P32455 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP1P32455 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP1P32455 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP1P32455 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP1P32455 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP1P32455 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP1P32455 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP1P32455 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP1P32455 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP1P32455 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP1P32455 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP1P32455 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP1P32455 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP1P32455 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP1P32455 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP1P32455 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP1P32455 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP1P32455 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP1P32455 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP1P32455 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP1P32455 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP1P32455 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP1P32455 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP1P32455 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP1P32455 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP1P32455 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP1P32455 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP1P32455 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP1P32455 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP1P32455 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP1P32455 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP1P32455 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP1P32455 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP1P32455 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP1P32455 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP1P32455 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP1P32455 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP1P32455 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP1P32455 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP1P32455 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP1P32455 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP1P32455 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP1P32455 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP1P32455 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP1P32455 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP1P32455 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP1P32455 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP1P32455 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP1P32455 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP1P32455 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP1P32455 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP1P32455 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP1P32455 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP1P32455 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP1P32455 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms