Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXN2P32314 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN2P32314 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN2P32314 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 426.9 ms