Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPP30301 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPP30301 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPP30301 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPP30301 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPP30301 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPP30301 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPP30301 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPP30301 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPP30301 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPP30301 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPP30301 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPP30301 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPP30301 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPP30301 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPP30301 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPP30301 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPP30301 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPP30301 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPP30301 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIPP30301 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIPP30301 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIPP30301 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPP30301 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPP30301 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPP30301 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPP30301 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPP30301 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPP30301 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPP30301 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPP30301 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPP30301 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPP30301 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPP30301 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPP30301 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPP30301 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPP30301 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPP30301 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPP30301 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPP30301 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPP30301 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIPP30301 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MIPP30301 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIPP30301 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIPP30301 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIPP30301 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIPP30301 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPP30301 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPP30301 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPP30301 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPP30301 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPP30301 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPP30301 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPP30301 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPP30301 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPP30301 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPP30301 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPP30301 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIPP30301 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIPP30301 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPP30301 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPP30301 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPP30301 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPP30301 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPP30301 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPP30301 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPP30301 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIPP30301 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIPP30301 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPP30301 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIPP30301 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIPP30301 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIPP30301 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIPP30301 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIPP30301 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPP30301 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPP30301 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPP30301 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPP30301 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPP30301 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPP30301 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPP30301 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIPP30301 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIPP30301 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms