Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD38P28907 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD38P28907 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD38P28907 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD38P28907 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD38P28907 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD38P28907 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD38P28907 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD38P28907 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CD38P28907 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD38P28907 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD38P28907 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD38P28907 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD38P28907 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD38P28907 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD38P28907 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD38P28907 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD38P28907 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD38P28907 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD38P28907 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD38P28907 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD38P28907 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD38P28907 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD38P28907 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD38P28907 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD38P28907 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD38P28907 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD38P28907 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD38P28907 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD38P28907 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD38P28907 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD38P28907 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD38P28907 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD38P28907 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD38P28907 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD38P28907 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD38P28907 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD38P28907 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD38P28907 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD38P28907 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD38P28907 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD38P28907 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD38P28907 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD38P28907 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD38P28907 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD38P28907 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD38P28907 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD38P28907 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD38P28907 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD38P28907 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD38P28907 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD38P28907 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD38P28907 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD38P28907 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD38P28907 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD38P28907 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD38P28907 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD38P28907 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD38P28907 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD38P28907 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms