Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIAP25963 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIAP25963 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms