Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSSP25774 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSSP25774 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSSP25774 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSSP25774 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSSP25774 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSSP25774 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSSP25774 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSSP25774 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSSP25774 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSSP25774 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSSP25774 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSSP25774 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSSP25774 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSSP25774 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSSP25774 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSSP25774 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSSP25774 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSSP25774 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSSP25774 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSSP25774 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSSP25774 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSSP25774 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSSP25774 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSSP25774 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSSP25774 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSSP25774 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSSP25774 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSSP25774 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSSP25774 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSSP25774 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSSP25774 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSSP25774 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSSP25774 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSSP25774 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSSP25774 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSSP25774 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSSP25774 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSSP25774 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSSP25774 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSSP25774 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSSP25774 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSSP25774 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSSP25774 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSSP25774 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSSP25774 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSSP25774 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSSP25774 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSSP25774 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSSP25774 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSSP25774 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSSP25774 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSSP25774 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSSP25774 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSSP25774 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSSP25774 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSSP25774 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSSP25774 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSSP25774 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSSP25774 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSSP25774 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSSP25774 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSSP25774 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSSP25774 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSSP25774 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSSP25774 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSSP25774 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSSP25774 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSSP25774 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSSP25774 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms