Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCHP24723 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCHP24723 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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