Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A2P23975 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A2P23975 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms