Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBG1P23258 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBG1P23258 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBG1P23258 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms