Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCMT1P22061 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMT1P22061 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMT1P22061 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms