Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NF1P21359 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NF1P21359 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NF1P21359 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NF1P21359 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NF1P21359 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NF1P21359 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NF1P21359 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NF1P21359 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NF1P21359 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NF1P21359 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NF1P21359 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NF1P21359 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NF1P21359 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NF1P21359 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NF1P21359 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NF1P21359 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NF1P21359 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NF1P21359 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NF1P21359 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NF1P21359 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NF1P21359 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NF1P21359 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NF1P21359 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NF1P21359 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NF1P21359 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NF1P21359 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NF1P21359 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NF1P21359 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NF1P21359 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NF1P21359 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
NF1P21359 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NF1P21359 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NF1P21359 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NF1P21359 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NF1P21359 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NF1P21359 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NF1P21359 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NF1P21359 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NF1P21359 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NF1P21359 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NF1P21359 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NF1P21359 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NF1P21359 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NF1P21359 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NF1P21359 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NF1P21359 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NF1P21359 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NF1P21359 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NF1P21359 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NF1P21359 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NF1P21359 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NF1P21359 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NF1P21359 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NF1P21359 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NF1P21359 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NF1P21359 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms