Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD247P20963 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD247P20963 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD247P20963 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD247P20963 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD247P20963 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD247P20963 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD247P20963 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD247P20963 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD247P20963 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD247P20963 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD247P20963 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD247P20963 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD247P20963 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD247P20963 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD247P20963 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD247P20963 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD247P20963 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD247P20963 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD247P20963 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD247P20963 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD247P20963 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD247P20963 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD247P20963 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD247P20963 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD247P20963 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD247P20963 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD247P20963 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD247P20963 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD247P20963 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD247P20963 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD247P20963 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD247P20963 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD247P20963 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD247P20963 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD247P20963 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD247P20963 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD247P20963 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD247P20963 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD247P20963 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD247P20963 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD247P20963 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD247P20963 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD247P20963 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD247P20963 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD247P20963 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD247P20963 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD247P20963 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD247P20963 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD247P20963 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD247P20963 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD247P20963 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD247P20963 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD247P20963 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD247P20963 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD247P20963 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD247P20963 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD247P20963 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD247P20963 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD247P20963 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD247P20963 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD247P20963 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD247P20963 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD247P20963 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD247P20963 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD247P20963 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD247P20963 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms