Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB4AP20338 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB4AP20338 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB4AP20338 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms