Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKB1P19838 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFKB1P19838 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKB1P19838 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB1P19838 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms