Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCLP18206 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCLP18206 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCLP18206 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCLP18206 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCLP18206 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCLP18206 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCLP18206 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCLP18206 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCLP18206 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCLP18206 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCLP18206 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCLP18206 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCLP18206 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCLP18206 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCLP18206 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCLP18206 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCLP18206 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCLP18206 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCLP18206 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCLP18206 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCLP18206 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCLP18206 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCLP18206 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCLP18206 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCLP18206 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCLP18206 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VCLP18206 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCLP18206 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCLP18206 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCLP18206 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCLP18206 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCLP18206 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VCLP18206 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCLP18206 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCLP18206 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCLP18206 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCLP18206 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCLP18206 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCLP18206 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCLP18206 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCLP18206 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCLP18206 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCLP18206 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCLP18206 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCLP18206 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VCLP18206 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCLP18206 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCLP18206 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCLP18206 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCLP18206 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCLP18206 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VCLP18206 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCLP18206 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCLP18206 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCLP18206 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCLP18206 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCLP18206 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCLP18206 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCLP18206 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCLP18206 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCLP18206 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VCLP18206 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCLP18206 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCLP18206 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCLP18206 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCLP18206 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCLP18206 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCLP18206 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCLP18206 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCLP18206 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCLP18206 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCLP18206 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCLP18206 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCLP18206 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCLP18206 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCLP18206 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCLP18206 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCLP18206 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VCLP18206 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VCLP18206 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCLP18206 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCLP18206 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCLP18206 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCLP18206 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms