Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMD1P17707 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMD1P17707 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMD1P17707 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMD1P17707 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMD1P17707 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMD1P17707 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMD1P17707 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMD1P17707 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AMD1P17707 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AMD1P17707 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMD1P17707 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AMD1P17707 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMD1P17707 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AMD1P17707 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMD1P17707 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMD1P17707 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMD1P17707 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMD1P17707 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AMD1P17707 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMD1P17707 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AMD1P17707 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMD1P17707 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMD1P17707 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMD1P17707 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AMD1P17707 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMD1P17707 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AMD1P17707 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AMD1P17707 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AMD1P17707 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMD1P17707 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMD1P17707 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMD1P17707 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMD1P17707 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMD1P17707 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMD1P17707 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMD1P17707 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMD1P17707 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMD1P17707 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMD1P17707 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMD1P17707 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMD1P17707 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMD1P17707 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMD1P17707 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMD1P17707 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMD1P17707 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AMD1P17707 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMD1P17707 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms