Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H2AFXP16104 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFXP16104 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFXP16104 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms