Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2F2P13984 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2F2P13984 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2F2P13984 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2F2P13984 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2F2P13984 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2F2P13984 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2F2P13984 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2F2P13984 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2F2P13984 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms