Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HARSP12081 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HARSP12081 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HARSP12081 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HARSP12081 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HARSP12081 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HARSP12081 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HARSP12081 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HARSP12081 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HARSP12081 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HARSP12081 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HARSP12081 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HARSP12081 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARSP12081 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARSP12081 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARSP12081 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARSP12081 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARSP12081 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARSP12081 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HARSP12081 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HARSP12081 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HARSP12081 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HARSP12081 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HARSP12081 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HARSP12081 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HARSP12081 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HARSP12081 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HARSP12081 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HARSP12081 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HARSP12081 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HARSP12081 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HARSP12081 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HARSP12081 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HARSP12081 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HARSP12081 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HARSP12081 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HARSP12081 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HARSP12081 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HARSP12081 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HARSP12081 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HARSP12081 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARSP12081 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARSP12081 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARSP12081 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARSP12081 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HARSP12081 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HARSP12081 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HARSP12081 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HARSP12081 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HARSP12081 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HARSP12081 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HARSP12081 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HARSP12081 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HARSP12081 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HARSP12081 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HARSP12081 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HARSP12081 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HARSP12081 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HARSP12081 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HARSP12081 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HARSP12081 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HARSP12081 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HARSP12081 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HARSP12081 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HARSP12081 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARSP12081 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARSP12081 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARSP12081 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HARSP12081 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARSP12081 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HARSP12081 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HARSP12081 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HARSP12081 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARSP12081 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HARSP12081 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms