Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VDRP11473 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VDRP11473 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VDRP11473 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VDRP11473 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VDRP11473 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VDRP11473 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VDRP11473 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VDRP11473 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VDRP11473 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VDRP11473 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VDRP11473 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VDRP11473 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VDRP11473 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VDRP11473 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VDRP11473 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VDRP11473 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VDRP11473 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VDRP11473 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VDRP11473 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VDRP11473 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VDRP11473 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VDRP11473 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VDRP11473 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VDRP11473 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VDRP11473 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VDRP11473 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VDRP11473 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VDRP11473 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VDRP11473 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VDRP11473 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VDRP11473 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VDRP11473 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VDRP11473 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VDRP11473 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VDRP11473 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VDRP11473 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VDRP11473 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VDRP11473 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VDRP11473 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VDRP11473 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VDRP11473 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VDRP11473 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VDRP11473 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VDRP11473 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VDRP11473 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VDRP11473 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VDRP11473 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VDRP11473 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VDRP11473 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VDRP11473 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VDRP11473 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VDRP11473 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VDRP11473 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VDRP11473 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VDRP11473 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VDRP11473 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VDRP11473 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VDRP11473 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VDRP11473 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VDRP11473 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VDRP11473 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VDRP11473 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VDRP11473 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VDRP11473 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VDRP11473 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VDRP11473 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VDRP11473 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VDRP11473 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VDRP11473 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VDRP11473 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VDRP11473 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VDRP11473 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VDRP11473 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VDRP11473 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VDRP11473 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms