Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF1P10914 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF1P10914 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF1P10914 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF1P10914 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF1P10914 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF1P10914 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF1P10914 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF1P10914 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF1P10914 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF1P10914 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF1P10914 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF1P10914 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF1P10914 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF1P10914 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF1P10914 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF1P10914 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF1P10914 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRF1P10914 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF1P10914 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF1P10914 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF1P10914 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF1P10914 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF1P10914 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF1P10914 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF1P10914 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF1P10914 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF1P10914 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF1P10914 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF1P10914 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF1P10914 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF1P10914 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF1P10914 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF1P10914 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF1P10914 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF1P10914 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF1P10914 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF1P10914 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF1P10914 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF1P10914 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF1P10914 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF1P10914 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF1P10914 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF1P10914 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF1P10914 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF1P10914 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF1P10914 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF1P10914 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF1P10914 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF1P10914 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF1P10914 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF1P10914 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF1P10914 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF1P10914 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF1P10914 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF1P10914 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF1P10914 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF1P10914 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF1P10914 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF1P10914 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF1P10914 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF1P10914 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF1P10914 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF1P10914 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF1P10914 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF1P10914 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF1P10914 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF1P10914 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF1P10914 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF1P10914 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF1P10914 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF1P10914 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF1P10914 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF1P10914 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF1P10914 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF1P10914 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF1P10914 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms