Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRGAP2BP0DMP2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP2BP0DMP2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2BP0DMP2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms