Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA8P0DM63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPIPA8P0DM63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA8P0DM63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms