Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGA3P0DJD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGA3P0DJD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGA3P0DJD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms