Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB1P08183 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB1P08183 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms