Protein–RNA interactions for Protein: P07996

THBS1, Thrombospondin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1P07996 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS1P07996 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS1P07996 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS1P07996 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS1P07996 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS1P07996 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS1P07996 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS1P07996 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS1P07996 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS1P07996 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS1P07996 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS1P07996 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS1P07996 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS1P07996 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS1P07996 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS1P07996 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS1P07996 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS1P07996 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS1P07996 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS1P07996 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS1P07996 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS1P07996 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS1P07996 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS1P07996 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS1P07996 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS1P07996 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS1P07996 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS1P07996 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS1P07996 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS1P07996 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS1P07996 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS1P07996 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS1P07996 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS1P07996 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS1P07996 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS1P07996 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS1P07996 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS1P07996 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS1P07996 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS1P07996 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS1P07996 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS1P07996 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS1P07996 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS1P07996 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS1P07996 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS1P07996 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THBS1P07996 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THBS1P07996 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS1P07996 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS1P07996 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS1P07996 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS1P07996 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS1P07996 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS1P07996 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THBS1P07996 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THBS1P07996 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
THBS1P07996 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THBS1P07996 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS1P07996 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THBS1P07996 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS1P07996 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS1P07996 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS1P07996 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS1P07996 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THBS1P07996 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms