Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETP07949 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETP07949 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETP07949 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETP07949 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETP07949 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETP07949 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETP07949 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETP07949 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETP07949 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETP07949 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETP07949 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETP07949 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETP07949 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETP07949 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETP07949 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETP07949 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETP07949 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETP07949 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETP07949 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETP07949 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RETP07949 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETP07949 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETP07949 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETP07949 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETP07949 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETP07949 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETP07949 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETP07949 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETP07949 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETP07949 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETP07949 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RETP07949 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETP07949 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETP07949 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETP07949 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETP07949 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETP07949 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETP07949 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETP07949 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETP07949 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETP07949 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETP07949 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETP07949 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETP07949 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETP07949 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETP07949 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETP07949 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETP07949 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETP07949 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETP07949 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETP07949 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RETP07949 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETP07949 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETP07949 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETP07949 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETP07949 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETP07949 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETP07949 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETP07949 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETP07949 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETP07949 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETP07949 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETP07949 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETP07949 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETP07949 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RETP07949 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETP07949 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETP07949 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETP07949 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETP07949 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RETP07949 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RETP07949 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETP07949 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETP07949 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETP07949 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETP07949 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETP07949 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETP07949 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETP07949 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETP07949 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETP07949 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETP07949 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETP07949 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETP07949 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETP07949 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETP07949 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETP07949 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETP07949 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETP07949 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETP07949 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETP07949 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RETP07949 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETP07949 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETP07949 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETP07949 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETP07949 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETP07949 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETP07949 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETP07949 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms