Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCKP06239 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCKP06239 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCKP06239 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCKP06239 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCKP06239 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCKP06239 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCKP06239 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCKP06239 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCKP06239 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCKP06239 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCKP06239 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCKP06239 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCKP06239 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCKP06239 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCKP06239 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCKP06239 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCKP06239 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCKP06239 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCKP06239 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCKP06239 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCKP06239 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCKP06239 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCKP06239 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCKP06239 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCKP06239 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCKP06239 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCKP06239 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCKP06239 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCKP06239 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCKP06239 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCKP06239 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCKP06239 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCKP06239 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCKP06239 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCKP06239 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCKP06239 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCKP06239 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCKP06239 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCKP06239 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCKP06239 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCKP06239 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCKP06239 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCKP06239 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCKP06239 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCKP06239 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCKP06239 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCKP06239 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCKP06239 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LCKP06239 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCKP06239 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCKP06239 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCKP06239 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCKP06239 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCKP06239 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCKP06239 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCKP06239 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCKP06239 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCKP06239 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms