Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG5P05408 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG5P05408 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG5P05408 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG5P05408 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG5P05408 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG5P05408 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG5P05408 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG5P05408 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG5P05408 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG5P05408 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCG5P05408 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG5P05408 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG5P05408 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCG5P05408 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCG5P05408 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG5P05408 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG5P05408 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG5P05408 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG5P05408 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG5P05408 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG5P05408 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCG5P05408 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCG5P05408 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCG5P05408 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCG5P05408 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG5P05408 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG5P05408 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG5P05408 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG5P05408 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG5P05408 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG5P05408 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG5P05408 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG5P05408 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG5P05408 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG5P05408 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG5P05408 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG5P05408 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG5P05408 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG5P05408 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG5P05408 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG5P05408 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG5P05408 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG5P05408 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG5P05408 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG5P05408 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG5P05408 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG5P05408 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG5P05408 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG5P05408 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG5P05408 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG5P05408 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG5P05408 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG5P05408 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG5P05408 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCG5P05408 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG5P05408 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG5P05408 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG5P05408 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG5P05408 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG5P05408 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG5P05408 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG5P05408 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG5P05408 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG5P05408 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms