Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFIP05156 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFIP05156 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFIP05156 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFIP05156 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFIP05156 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFIP05156 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFIP05156 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFIP05156 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFIP05156 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFIP05156 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFIP05156 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFIP05156 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFIP05156 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFIP05156 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFIP05156 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFIP05156 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFIP05156 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFIP05156 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFIP05156 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFIP05156 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFIP05156 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFIP05156 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFIP05156 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFIP05156 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFIP05156 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFIP05156 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFIP05156 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFIP05156 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFIP05156 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFIP05156 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFIP05156 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFIP05156 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFIP05156 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFIP05156 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFIP05156 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFIP05156 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFIP05156 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFIP05156 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFIP05156 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFIP05156 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFIP05156 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFIP05156 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFIP05156 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFIP05156 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFIP05156 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFIP05156 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFIP05156 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFIP05156 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFIP05156 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFIP05156 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFIP05156 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFIP05156 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFIP05156 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFIP05156 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFIP05156 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFIP05156 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFIP05156 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFIP05156 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFIP05156 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFIP05156 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFIP05156 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFIP05156 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFIP05156 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFIP05156 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFIP05156 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFIP05156 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFIP05156 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFIP05156 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CFIP05156 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CFIP05156 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CFIP05156 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms