Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCGP05129 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCGP05129 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms