Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGB2P05107 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB2P05107 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms