Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYBBP04839 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYBBP04839 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYBBP04839 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBBP04839 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBBP04839 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBBP04839 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBBP04839 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBBP04839 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBBP04839 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBBP04839 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBBP04839 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBBP04839 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBBP04839 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBBP04839 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBBP04839 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBBP04839 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBBP04839 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYBBP04839 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYBBP04839 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYBBP04839 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBBP04839 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYBBP04839 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYBBP04839 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYBBP04839 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYBBP04839 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBBP04839 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBBP04839 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBBP04839 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBBP04839 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBBP04839 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBBP04839 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBBP04839 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYBBP04839 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYBBP04839 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYBBP04839 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBBP04839 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYBBP04839 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYBBP04839 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYBBP04839 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYBBP04839 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBBP04839 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYBBP04839 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYBBP04839 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYBBP04839 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYBBP04839 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYBBP04839 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYBBP04839 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBBP04839 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBBP04839 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBBP04839 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBBP04839 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBBP04839 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBBP04839 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYBBP04839 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYBBP04839 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBBP04839 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBBP04839 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBBP04839 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBBP04839 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYBBP04839 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms