Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THY1P04216 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THY1P04216 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THY1P04216 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THY1P04216 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THY1P04216 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THY1P04216 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THY1P04216 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THY1P04216 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THY1P04216 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THY1P04216 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THY1P04216 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THY1P04216 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THY1P04216 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THY1P04216 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THY1P04216 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THY1P04216 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THY1P04216 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THY1P04216 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THY1P04216 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THY1P04216 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THY1P04216 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THY1P04216 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THY1P04216 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THY1P04216 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THY1P04216 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THY1P04216 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THY1P04216 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THY1P04216 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THY1P04216 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THY1P04216 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THY1P04216 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THY1P04216 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THY1P04216 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THY1P04216 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THY1P04216 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THY1P04216 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THY1P04216 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THY1P04216 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THY1P04216 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
THY1P04216 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THY1P04216 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THY1P04216 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THY1P04216 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THY1P04216 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THY1P04216 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THY1P04216 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THY1P04216 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THY1P04216 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THY1P04216 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THY1P04216 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THY1P04216 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THY1P04216 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THY1P04216 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THY1P04216 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THY1P04216 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THY1P04216 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THY1P04216 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THY1P04216 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THY1P04216 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THY1P04216 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THY1P04216 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THY1P04216 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THY1P04216 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THY1P04216 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THY1P04216 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THY1P04216 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THY1P04216 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THY1P04216 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THY1P04216 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THY1P04216 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THY1P04216 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THY1P04216 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THY1P04216 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THY1P04216 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THY1P04216 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THY1P04216 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THY1P04216 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THY1P04216 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THY1P04216 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THY1P04216 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THY1P04216 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THY1P04216 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THY1P04216 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THY1P04216 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THY1P04216 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms