Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYCNP04198 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYCNP04198 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYCNP04198 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYCNP04198 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYCNP04198 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYCNP04198 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYCNP04198 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCNP04198 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCNP04198 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCNP04198 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCNP04198 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCNP04198 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCNP04198 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCNP04198 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYCNP04198 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYCNP04198 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYCNP04198 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYCNP04198 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYCNP04198 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYCNP04198 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYCNP04198 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYCNP04198 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYCNP04198 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MYCNP04198 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYCNP04198 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYCNP04198 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYCNP04198 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MYCNP04198 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYCNP04198 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYCNP04198 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYCNP04198 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYCNP04198 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYCNP04198 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYCNP04198 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYCNP04198 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYCNP04198 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYCNP04198 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYCNP04198 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYCNP04198 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYCNP04198 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MYCNP04198 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYCNP04198 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYCNP04198 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYCNP04198 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYCNP04198 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYCNP04198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MYCNP04198 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYCNP04198 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYCNP04198 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYCNP04198 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MYCNP04198 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYCNP04198 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYCNP04198 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MYCNP04198 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MYCNP04198 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYCNP04198 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYCNP04198 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MYCNP04198 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYCNP04198 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYCNP04198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCNP04198 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCNP04198 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCNP04198 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCNP04198 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCNP04198 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCNP04198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCNP04198 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYCNP04198 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYCNP04198 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYCNP04198 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCNP04198 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYCNP04198 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYCNP04198 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYCNP04198 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYCNP04198 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYCNP04198 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYCNP04198 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYCNP04198 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYCNP04198 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYCNP04198 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYCNP04198 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYCNP04198 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYCNP04198 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms