Protein–RNA interactions for Protein: P01718

IGLV3-27, Immunoglobulin lambda variable 3-27, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-27P01718 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-27P01718 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-27P01718 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-27P01718 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-27P01718 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-27P01718 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-27P01718 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-27P01718 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGLV3-27P01718 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IGLV3-27P01718 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGLV3-27P01718 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms