Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOSP01100 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOSP01100 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSP01100 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSP01100 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSP01100 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSP01100 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSP01100 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSP01100 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSP01100 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSP01100 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSP01100 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSP01100 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSP01100 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSP01100 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOSP01100 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOSP01100 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSP01100 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSP01100 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSP01100 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSP01100 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSP01100 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSP01100 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSP01100 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSP01100 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSP01100 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSP01100 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSP01100 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSP01100 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSP01100 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSP01100 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSP01100 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSP01100 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSP01100 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSP01100 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSP01100 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSP01100 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOSP01100 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOSP01100 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSP01100 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSP01100 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSP01100 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSP01100 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSP01100 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSP01100 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSP01100 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSP01100 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSP01100 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSP01100 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSP01100 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSP01100 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSP01100 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSP01100 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSP01100 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSP01100 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSP01100 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSP01100 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSP01100 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSP01100 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSP01100 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSP01100 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSP01100 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSP01100 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSP01100 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSP01100 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSP01100 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSP01100 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSP01100 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSP01100 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSP01100 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSP01100 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSP01100 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSP01100 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOSP01100 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOSP01100 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms