Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPP00450 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPP00450 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPP00450 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPP00450 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPP00450 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPP00450 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPP00450 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPP00450 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPP00450 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPP00450 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPP00450 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPP00450 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPP00450 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPP00450 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPP00450 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPP00450 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPP00450 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CPP00450 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPP00450 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPP00450 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPP00450 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPP00450 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPP00450 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPP00450 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPP00450 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CPP00450 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPP00450 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPP00450 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPP00450 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPP00450 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPP00450 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPP00450 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPP00450 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPP00450 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPP00450 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPP00450 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPP00450 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPP00450 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPP00450 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPP00450 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPP00450 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPP00450 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPP00450 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPP00450 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPP00450 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPP00450 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPP00450 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPP00450 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPP00450 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPP00450 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPP00450 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPP00450 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPP00450 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPP00450 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPP00450 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPP00450 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPP00450 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPP00450 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPP00450 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CPP00450 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPP00450 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPP00450 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPP00450 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPP00450 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPP00450 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPP00450 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPP00450 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPP00450 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms