Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPTM1O96005 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPTM1O96005 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms