Protein–RNA interactions for Protein: O95992

CH25H, Cholesterol 25-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CH25HO95992 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CH25HO95992 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CH25HO95992 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CH25HO95992 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CH25HO95992 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CH25HO95992 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CH25HO95992 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CH25HO95992 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CH25HO95992 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CH25HO95992 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CH25HO95992 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CH25HO95992 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CH25HO95992 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CH25HO95992 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CH25HO95992 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CH25HO95992 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CH25HO95992 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CH25HO95992 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CH25HO95992 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CH25HO95992 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CH25HO95992 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CH25HO95992 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CH25HO95992 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CH25HO95992 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CH25HO95992 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CH25HO95992 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CH25HO95992 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CH25HO95992 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CH25HO95992 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CH25HO95992 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CH25HO95992 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CH25HO95992 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CH25HO95992 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CH25HO95992 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CH25HO95992 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CH25HO95992 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CH25HO95992 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CH25HO95992 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CH25HO95992 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CH25HO95992 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CH25HO95992 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CH25HO95992 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CH25HO95992 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CH25HO95992 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CH25HO95992 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CH25HO95992 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CH25HO95992 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CH25HO95992 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CH25HO95992 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CH25HO95992 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CH25HO95992 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CH25HO95992 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CH25HO95992 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CH25HO95992 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CH25HO95992 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CH25HO95992 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CH25HO95992 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CH25HO95992 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CH25HO95992 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms