Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POP4O95707 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POP4O95707 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP4O95707 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP4O95707 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP4O95707 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POP4O95707 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POP4O95707 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP4O95707 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP4O95707 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP4O95707 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP4O95707 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP4O95707 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP4O95707 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP4O95707 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP4O95707 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP4O95707 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP4O95707 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP4O95707 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP4O95707 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP4O95707 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP4O95707 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP4O95707 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP4O95707 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP4O95707 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP4O95707 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP4O95707 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP4O95707 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POP4O95707 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP4O95707 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP4O95707 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP4O95707 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP4O95707 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP4O95707 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP4O95707 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP4O95707 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP4O95707 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP4O95707 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP4O95707 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP4O95707 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP4O95707 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP4O95707 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP4O95707 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP4O95707 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POP4O95707 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP4O95707 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP4O95707 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP4O95707 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP4O95707 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POP4O95707 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP4O95707 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP4O95707 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP4O95707 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP4O95707 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP4O95707 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP4O95707 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POP4O95707 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP4O95707 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP4O95707 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POP4O95707 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP4O95707 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP4O95707 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP4O95707 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP4O95707 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POP4O95707 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POP4O95707 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 515.9 ms