Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBB3O95704 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBB3O95704 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APBB3O95704 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APBB3O95704 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBB3O95704 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBB3O95704 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBB3O95704 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APBB3O95704 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBB3O95704 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBB3O95704 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBB3O95704 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBB3O95704 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBB3O95704 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBB3O95704 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APBB3O95704 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBB3O95704 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBB3O95704 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBB3O95704 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBB3O95704 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APBB3O95704 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APBB3O95704 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBB3O95704 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBB3O95704 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBB3O95704 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBB3O95704 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APBB3O95704 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBB3O95704 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBB3O95704 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBB3O95704 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APBB3O95704 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APBB3O95704 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APBB3O95704 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APBB3O95704 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APBB3O95704 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBB3O95704 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBB3O95704 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBB3O95704 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBB3O95704 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBB3O95704 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APBB3O95704 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBB3O95704 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBB3O95704 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APBB3O95704 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBB3O95704 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APBB3O95704 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBB3O95704 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBB3O95704 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APBB3O95704 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APBB3O95704 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBB3O95704 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBB3O95704 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBB3O95704 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBB3O95704 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APBB3O95704 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBB3O95704 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBB3O95704 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APBB3O95704 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APBB3O95704 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APBB3O95704 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APBB3O95704 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APBB3O95704 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APBB3O95704 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBB3O95704 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBB3O95704 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBB3O95704 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBB3O95704 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APBB3O95704 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBB3O95704 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APBB3O95704 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms