Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZIC2O95409 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZIC2O95409 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZIC2O95409 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZIC2O95409 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms