Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR47O94967 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR47O94967 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR47O94967 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR47O94967 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR47O94967 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR47O94967 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR47O94967 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR47O94967 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR47O94967 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR47O94967 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR47O94967 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR47O94967 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR47O94967 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR47O94967 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR47O94967 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR47O94967 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR47O94967 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR47O94967 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR47O94967 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR47O94967 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR47O94967 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR47O94967 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR47O94967 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR47O94967 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR47O94967 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR47O94967 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR47O94967 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR47O94967 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR47O94967 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR47O94967 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR47O94967 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR47O94967 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR47O94967 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR47O94967 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR47O94967 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR47O94967 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR47O94967 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR47O94967 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR47O94967 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR47O94967 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR47O94967 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR47O94967 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR47O94967 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR47O94967 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR47O94967 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR47O94967 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR47O94967 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR47O94967 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR47O94967 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR47O94967 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR47O94967 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR47O94967 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR47O94967 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR47O94967 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR47O94967 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR47O94967 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR47O94967 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR47O94967 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR47O94967 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR47O94967 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR47O94967 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms