Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRIG2O94898 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIG2O94898 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG2O94898 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG2O94898 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms