Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms