Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM2O94769 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM2O94769 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM2O94769 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM2O94769 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM2O94769 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM2O94769 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM2O94769 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM2O94769 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM2O94769 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM2O94769 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM2O94769 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM2O94769 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM2O94769 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM2O94769 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM2O94769 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM2O94769 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM2O94769 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM2O94769 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM2O94769 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM2O94769 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM2O94769 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM2O94769 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM2O94769 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM2O94769 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM2O94769 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM2O94769 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM2O94769 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM2O94769 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM2O94769 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM2O94769 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM2O94769 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM2O94769 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM2O94769 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM2O94769 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM2O94769 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM2O94769 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM2O94769 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM2O94769 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM2O94769 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM2O94769 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM2O94769 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM2O94769 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM2O94769 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM2O94769 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM2O94769 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM2O94769 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM2O94769 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM2O94769 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM2O94769 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM2O94769 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM2O94769 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM2O94769 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM2O94769 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM2O94769 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM2O94769 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM2O94769 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM2O94769 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM2O94769 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ECM2O94769 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM2O94769 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM2O94769 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM2O94769 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM2O94769 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM2O94769 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM2O94769 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM2O94769 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM2O94769 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM2O94769 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM2O94769 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM2O94769 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM2O94769 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM2O94769 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM2O94769 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM2O94769 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM2O94769 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1254.5 ms